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本发明公开了一种阳离子聚合物基因载体及其制备方法,所述阳离子聚合物基因载体为改性修饰的聚缩水甘油胺,改性修饰剂为对甲基苯磺酰基封端聚乙二醇单甲醚、羧基封端聚乙二醇单甲醚、低聚糖、有机疏水性物质或两性离子,低聚糖为麦芽糖、葡萄糖、甘露糖中的至少一种,有机疏水性物质为月桂酸、月桂醛、聚乳酸、聚己内酯、乳酸羟基乙酸共聚物、胆固醇中的至少一种,两性离子为丙内酯、丁内酯、戊内酯、己内酯、1,3-丙烷磺酸内酯、1,4-丁烷磺酸内酯、1,5-戊烷磺酸内酯中的至少一种;其中,改性修饰剂在聚缩水甘油胺上的接枝率为5%~50%。本发明提供的改性修饰的聚缩水甘油胺,作为非病毒基因转染载体,具有很高的生物兼容性和基因转染能力以及较低的细胞毒性。