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本发明属于生物技术领域,具体涉及一种来源于Erwiniasp.Ejp617的蔗糖异构酶突变体及其编码基因、含有该突变体基因的重组载体以及蔗糖异构酶突变体生物催化蔗糖制备异麦芽酮糖中的应用。所述蔗糖异构酶突变体氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。本发明构建了一个酶活和催化效率均得到了提高的蔗糖异构酶双重突变体Q209S/R456H,在pH 6.0,30℃的水浴中,蔗糖异构酶突变体Q209S/R456H的酶活达到684U/mg,催化效率是野生型蔗糖异构酶的16倍以上;酶动力学分析显示,Q209S/R456H的K-(m)值分别比天然酶下降了48.7%,k-(cat)值是天然酶的8.3倍;催化效率k-(cat)/K-(m)是WT的16倍以上。催化蔗糖生产异麦芽酮糖时,突变体的异麦芽酮糖最大转化率比天然酶提高了19.3%。