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本发明公开了一种高强度超声经颅聚焦时产生的驻波抑制方法,对高强度聚焦超声经颅治疗时因颅骨存在而形成的驻波进行抑制,从而降低驻波的强度,同时可提升焦域聚焦能量的方法。它包括以下步骤:S1:利用Matlab中random函数生成随机相位序列;S2:将生成的随机相位序列每隔固定时间间隔加入至阵元激励函数中;S3:选择不同的相位转换时间间隔,利用驻波比R a 评价驻波强度,选取驻波抑制效果最优的时间间隔;S4:在其他输入不变的条件下根据选取的最佳相位转换时间间隔进行驻波抑制,利用调整后的激励函数激励换能器进行聚焦。本发明可实现经颅聚焦同时有效抑制驻波,并附带提高焦域能量加速温升的效果。