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本发明涉及海洋微生物培养技术领域,尤其涉及一种深海微生物水体原位培养装置,包括上顶盖、外壳、固定部、支架组件以及多个培养单元;外壳具有一内腔,外壳上形成有与内腔连通的取放口,上顶盖与外壳连接并用于闭合取放口;外壳上开设有与内腔连通的若干流通孔;固定部设置在外壳上并用于将外壳附挂于深海区;多个培养单元分别用于盛装微生物培养基并能够使微生物培养基与外界进行物质交换;支架组件用于将多个培养单元固定于内腔;通过设置固定部、外壳以及上顶盖形成刚性保护结构,避免水下复杂的水流或大生物对该培养装置内外部造成破坏;通过设置支架组件,有效保护了培养单元,进而使得该培养装置可在深海环境中进行微生物的长期培养。