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本发明公开了一种癌细胞识别方法、装置和系统。方法包括处理细胞图像以获取第一特征图;处理第一特征图以获得集合;处理集合以获得第二特征图,处理第二特征图以获得癌细胞检测框和癌细胞编码;基于深度学习网络处理癌细胞检测框以输出种类信息。本发明通过处理细胞图像以获得椭圆的细胞候选框的集合,椭圆形候选框相对于正常的矩形框,能够降低后续处理时出现的背景噪音;处理集合以获得癌细胞检测框和癌细胞编码,分割癌细胞以供种类分析,癌细胞编码能降低后续批量处理图像难度;处理癌细胞检测框以输出种类信息,能够通过成熟的深度学习网络识别得到癌细胞的类型,相对于现有的识别方式,更能适应复杂细胞环境下的癌细胞识别。