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本发明公开了一种灭菌机器人系统,包括:采集机器人、细菌试管、试管温度调节单元、含酶磁珠粒子群、粒子驱动模块、细菌识别模块、灭菌机器人和远程控制端,其中,采集机器人以细菌试管采集细菌以形成细菌溶液;粒子驱动模块基于电磁共振感应原理驱动含酶磁珠粒子群;细菌识别模块基于细菌溶液阻抗变化识别细菌类型;远程控制端基于细菌类型输出处理指令以控制灭菌机器人。本发明通过采集机器人采集细菌以避免人与细菌的直接接触,通过磁珠粒子处理细菌以改变细菌溶液的物化性质,通过阻抗变换识别细菌类型,通过远程控制端控制灭菌机器人以实现灭菌过程,能快速完成识别细菌和灭菌过程,同时降低灭菌过程的人员作业的风险。