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本发明提供了一种表面具有拓扑图案的PEEK的制备方法。所述制备方法包括如下步骤:(1)将PEEK材料置于表面具有拓扑图案的模板上,通过冷压、热压或先冷压后加热的方法,将所述PEEK材料压制成型,同时使所述模板上的拓扑图案转移到压制成型的PEEK表面;(2)将所述模板与所述压制成型的PEEK分离,得到表面具有拓扑图案的PEEK。本发明提供的方法可以在PEEK表面大面积形成自主设计的拓扑图案,形成的拓扑图案具有较高的分辨率,且可通过调节挤压成型的条件调节图案化后的PEEK的弹性模量,以适应不同的应用需求。