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本发明属于植物杂交育种技术。为解决提高栽培稻与不同基因型野生稻杂交种难以发芽、培养成苗率低的难题及为大幅度提高野栽远缘杂交种幼胚培养成苗率的问题特提出本方案。该方法是在栽培稻雌本和不同基因组野生稻的雄本授粉杂交后最佳栽培期,经判定去除假杂交种籽粒,并将真杂交种籽粒取下,脱颖壳消毒后直接放入培养基培养。这样能提高培养出的野栽交苗纯度,并能稳定提高幼胚出苗率,由一般的5%-50%稳定提高到35%-70%。而且,该方法能降低成本、技术难度低、好操作,为作物遗传育种种质资源的创新提供规范化的新方法。