[00114660]文昌鸡与北京油鸡肌肉组织基因组甲基化的比较研究

1、研究背景： DNA甲基化是一种常见的表观遗传修饰方式,主要出现在CpG二核苷酸的胞嘧啶第五位碳原子上,,对骨骼肌发生具有重要的调控作用,它参与调节肌肉发育及再生过程中相关基因的转录。肌肉是畜禽胴体中最主要的组成成分,是养殖业的主要产品之一,动物肌肉产品的“高效和优质”生产是决定养殖者效益的两个关键因素。本研究采用MSAP方法对文昌鸡和北京油鸡肌肉组织DNA甲基化状态进行比较分析,探讨DNA甲基化在鸡肌肉发育过程中的作用机制,为更好地开展地方家禽遗传改良提供新的思路并奠定基础。 2、研究内容及方法： （1）文昌鸡与北京油鸡肌肉组织基因组甲基化模式和水平研究：以文昌鸡与北京油鸡的胸肌和腿肌为研究对象,通过MSAP技术在全基因组水平检测两种鸡胸肌和腿肌DNA甲基化模式和水平,筛选文昌鸡和北京油鸡肌肉组织特异性的DNA甲基化片段。 （2）文昌鸡与北京油鸡肌肉组织特异性甲基化片段的克隆测序：回收文昌鸡与北京油鸡肌肉组织特异性的DNA甲基化片段,通过基因克隆测序技术获得肌肉组织特异性甲基化片段的序列信息。 （3）文昌鸡与北京油鸡肌肉组织特异性甲基化片段的生物信息学分析：利用生物信息学方法分析获得的特异性甲基化片段序列,确定特异性甲基化片段所属的功能基因,探讨文昌鸡与北京油鸡肌肉表观遗传的调控机理。 3、研究成果 采用甲基敏感扩增多态性技术检测了鸡胸肌和腿肌2个组织基因组在CCGG位点的甲基化状态,分析了不同组织的DNA甲基化水平及特异性甲基化模式,表明了4个鸡群中DNA甲基化程度均较高,其中胸肌基因组DNA的总甲基化水平分别是53.56%、52.82%、53.67%、54.82%,腿肌基因组DNA的总甲基化水平分别是52.85%、53.48%、51.87%、53.15%;在检测的胸肌和腿肌组织中,全甲基化条带数均高于半甲基化条带数;在4个不同鸡群间,基因组甲基化程度差异不显著（P ＞0.05）;对部分甲基化位点进行回收,鉴定出6个存在甲基化修饰的基因,分别为鸡ADAMTS5基因、ATP2A2基因、C8H1ORF27基因、C-SNO基因、FAM91A1基因、FBXO33基因。