[00120890]种猪全基因组选择技术研发与应用

本项目以建立先进的猪全基因组选择技术为根本目的,采用猪高密度基因芯片分型和基因组简化测序技术,获得覆盖整个猪基因组的SNP标记,建立全基因组标记信息数据库。通过全基因组关联分析,估计SNP效应,评估不同基因组选择模型的准确性,选择最佳的全基因组选择遗传评估GBLUP模型。根据SNP效应大小、标记密度、连锁关系等筛选有效SNP位点,设计和定制猪SNP基因芯片。通过基因型填充的方法,扩大群体验证SNP选种的相对准确性,完善模型参数。最后,利用建立的全基因组选择遗传评估模型结合表型遗传评估模型,制定并实施猪全基因组育种方案,培育种猪新品系。本项目的成功实施,不仅获得更全面的基因组信息,而且大大降低了研发成本。同时,将建立的基因组选择育种体系与现有传统育种体系有机结合,大大加快了基因组选择在猪商业化育种中应用的进程。并通过参考大量研究成果,结合前期分型结果得到的重要SNP位点、温氏多个核心品系特异性SNP位点,设计和定制适合温氏瘦肉型品系种猪育种专用的高密度SNP芯片,进一步提高了温氏瘦肉型品系种猪选种的准确性。 通过本项目的实施,建立了猪全基因组分子标记信息数据库,研制了可用于全基因组选择的基因芯片,构建了种猪全基因组选择遗传评估GBLUP模型以及提出了全基因组选择的方案,提高了瘦肉型品系种猪的选育准确度,对我国种猪育种选育技术的推进具备重大作用,提升了我国种猪育种技术的竞争力。通过种猪全基因组关联分析和全基因组选择技术平台的建立,逐步完善基于多学科研究手段的猪重要经济性状相关基因素材的挖掘技术,主要针对生产中难以选择和改良的重要经济性状进行定向育种,培育出一批专门化杜洛克种猪品系,提高种猪选种准确性,加快遗传改良进展,降低育种成本。通过产学研合作,研制的高密度和低密度芯片能够应用到全基因组选择育种中,将填补我国在基因组选择技术领域的研究空白,提高我国猪育种水平。同时,提高种猪育种中优质遗传资源的应用和养猪业生产水平及经济效益。