[00121461]基于RAD-seq技术的水青树SNP标记开发及其在保护遗传学和核心种质构建中的应用
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技术详细介绍
本项目首次采用RAD-Seq技术,开发了濒危植物水青树特异性的SNP标记2169对,并进行相应的群体遗传结构及多样性分析。该方法跨越了非模式生物与模式生物之间的门槛,不受限于参考基因组,快速鉴定出高密度的SNPs,为珍稀濒危植物保护遗传学研究开辟了新的途径。 根据遗传多样性水平数据,最终确定BSJ、BMXS种群为水青树就地保护的优先保护群体;现有水青树自然种群可以划分为5个进化显著单元,可分别作为保护管理单元加以保护;MLZ和HG两个自然种群遗传多样性相对较低,还需通过与同一保护管理单元内其他种群间的个体交流或者人工异花传粉以促进其种群间的基因交流,丰富其遗传多样性,最终提高种群进化潜力及增强后代个体适合度。以上保育策略的拟定,为水青树种质资源的有效保育和管理提供了科学依据。 利用SNP标记的遗传多样性数据确定了水青树种质资源库构建的最优取样策略,同时构建了核心种质,为水青树种质资源的有效保存、评价和合理利用提供科学依据。
