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本发明公开了一种先导化合物的合成及筛选的方法,它包括如下步骤: (1)取原料:取i种合成砌块与(i+2)种单链DNA片段; (2)用组合化学方法合成化合物,得到单链DNA标记的化合物的文库; (3)筛选:对DNA标记的化合物的文库进行筛选; (4)测序:取步骤(3)筛选得到的DNA标记的化合物,对DNA标记的化合物上的DNA测序,根据DNA序列即可确定该化合物的合成砌块和反应历程。 本发明还公开了一种先导化合物的合成及筛选试剂盒,以及一种组合化学文库。本发明方法及试剂盒可以快速有效地合成并筛选得到目的先导化合物,操作简便,成本低廉。