[00123860]人Autotaxin（ATX）基因及其编码蛋白的生物信息学分析

1、Autotaxin蛋白的磷酸化位点分析分别利用软件DISPHOS 1.3、PhosphoSitePlus、KinasePhos、Scansite、NetPhosk、Musite进行预测,这些软件是现今比较常用的磷酸化位点预测软件。6款软件预测的所有磷酸化位点中,有四款软件同时预测到的位点有2个;有三款软件同时预测到的位点有3个;有两款软件同时预测到的位点有12个。 2、Autotaxin（ATX）蛋白的糖基化位点（N-型、O-型）分别用NetNGlyc1.0、Uniprot数据库、NetOGlyc4.0、YinOYang1.2软件进行预测。N型糖基化位点的预测通过Uniprot数据库查询及NetNGlyc1.0软件预测,重复被预测到的位点为N-54。O型糖基化位点的预测通过NetOGlyc4.0、YinOYang1.2软件进行,重复被预测到的位点为O-695、O-696、O-712。 3、蛋白亚型的序列比对及二级结构对比用ESPript 3.0,结构域预测用Simple Modular Architecture Research Tool（SMART）,理化性质分析利用ProtParam tool,亲疏水性分析用ProtScale,跨膜结构预测利用TMHMM。