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本发明公开了一种曲霉菌基因检测芯片及其制作方法和使用方法。本发明的曲霉菌基因检测芯片,是根据曲霉菌基因组DNA序列,设计使每个探针解链温度相近,相同序列尽量减少,通用探针选取同一菌属中各菌种相同的序列区,并确定探针,在醛基修饰的载玻片表面点阵并固定。本发明的曲霉菌基因检测芯片可用于患者曲霉菌种的检测。本发明的曲霉菌基因检测芯片只需一次PCR扩增反应和杂交反应就可确定曲霉菌和隐球菌的种类,具有高的灵敏度和杂交特异性,使临床检测成为可能。(1)本发明的曲霉菌基因检测芯片只需一次PCR扩增反应和杂交反应就可确定曲霉菌和隐球菌的种类,具有高的灵敏度和杂交特异性,使临床检测成为可能。(2)本发明所采用的菌属通用探针,使检测分类更为具体和准确。由于缺乏对曲霉菌属各种菌种相应特异性的抗体,传统的血清学检测技术不能用于曲霉菌的检测。而PCR法用于检测曲霉菌种类,需多对特异性的引物,操作过程繁琐,在临床上无实用性。传统的培养法耗时长(7天)。因此目前绝大多数医院均未开展临床真菌学检测工作,医生往往凭经验诊治,容易造成误诊,难以准确治疗。用曲霉菌检测芯片,从样品制备到PCR扩增,得到检测结果,需6~8小时,大大缩短了病人的诊断时间,具有较好的临床推广使用价值。