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在本项目的资助下,我们完成了青菜的基因组重测序。在大规模生物信息学分析比较的基础上,开发了可用于重要农艺性状定位的SSR分子标记、SNP分子标记和INDEL分子标记,鉴定了多个与抗热抗涝和叶片形态等多个重要农艺性状相关的位点。这些分子标记还可以用于控制其它重要农艺性状位点的鉴定。 我们在青菜基因组中还鉴定了一系列热响应的保守和特异的miRNA以及来自顺式天然反向转录本(cis-NATs)的热响应siRNA (nat-siRNAs),包括35个与拟南芥同源的保守miRNA家族、21个来自19个新miRNA家族的成员和12对热响应nat-siRNAs的cis-NATs。我们的研究表明bra-miR398a和bra-miR398b受热抑制,它们所调控的靶基因BraCSD1在高温下显著累积,青菜和拟南芥的转基因分析也验证了bra-miR398和BraCSD1在植物抗热中的作用;bra-miR1885b.3和bra-miR5718在热处理条件下对预测的靶基因也有着潜在的负调控关系;Bra018216/Bra018217、Bra013578/Bra013579和Bra013578/Bra013579 cis-NATs中在热处理条件下的表达变化模式存在着负相关,对应着nat-siRNAs热诱导上调时,其互补的靶基因累积量降低。 我们的研究结果拓展了我们对miRNA和nat-siRNAs参与调控植物响应高温胁迫的理解,有助于我们在今后利用小RNA进行耐热品种改良的应用。