[00129657]基于转录组测序解析川白芷道地性特征的研究

1、川白芷根进行高通量转录组测序后,获得到47 044条unigenes,平均长度1 164.20 nt。BLAST分析显示分别有32 208 （68.46%）、23 049 （48.99%）、10 479 （22.27%）、17 883 （38.01%）、28 201 （59.95%）、20 731 （44.07%）、55 （0.12%）条unigenes在数据库NR、Swiss-port、KEGG、KOG、eggNOG、GO、Pfam中获得注释,可归为GO分类的生物过程、细胞组分和分子功能3大类57分支,涉及205个KEGG代谢通路,其中包括27个次生代谢通路。蛋白编码框序列32 303个,高等植物转录因子58个家族,借助MISA软件发现10 020个SSR,其中二碱基重复最丰富,有4 336个,出现频率为43.27%;五碱基重复SSR最少仅占0.37%。 2、川白芷产地间、亳白芷产地间及川白芷与亳白芷间的差异基因总数分别为2 686 条、1 704 条、11 549 条,分别被GO富集注释1 1 038 条、434 条、5 604 条,差异基因的主要功能与细胞组成、细胞、细胞器、结合、催化活性、细胞过程及代谢过程有关。 3、KEGG通路分类显示,差异表达基因被分为4大类,24个小类,所在通路主要与代谢过程相关。与白芷主要化学成分香豆素和挥发油合成相关的4-香豆酸连接酶、丙氨酸氨解酶、3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶在川白芷中表达量升高,1-脱氧-D-木糖-5-磷酸合成酶、脱氢多萜醇焦磷酸合成酶在川白芷中表达量降低。