[00129767]甘蔗黑穗病菌基因组框架图建立及致病相关基因鉴定

“甘蔗黑穗病菌基因组框架图建立及致病相关基因鉴定”项目是广西自然科学基金重点项目（合同编号：2010GXNSFD013026）,由广西大学和广西壮族自治区农业科学院植物保护研究所共同承担。 本项目针对甘蔗生产中出现的甘蔗黑穗病严重发生危害的问题,对引致甘蔗黑穗病的病原菌——甘蔗黑穗病菌（Sporisorium scitamineum）进行全基因组测序,构建甘蔗黑穗病菌基因组框架图,预测和确定致病相关基因,为开发新的防治技术提供基因靶标和理论依据。 项目研究成功分离单倍体菌株JG35 和JG36,该对菌株的二倍体菌丝对甘蔗有强致病力;完成了JG36 菌株的全基因组测序原始数据5.1Gb,获得了22 条染色体序列总长度19.32Mb,目前只剩下1 个内部洞,基因组框架图完整度超过99.99%;完成人工接种后甘蔗体内黑穗病菌二倍体的转录组测序,结合基因预测和转录组比对分析共预测到6665 个基因,与玉米黑穗病菌已知基因进行比对,发现两种菌中有5468 个基因存在高度同源关系。生物信息分析识别到47 个候选致病基因;利用根癌农杆菌介导的转化方法（ATMT）,大规模建立甘蔗黑穗病菌单倍体菌株 JG35 和 JG36 的突变体库,共获得了30000 个突变体;)验证了3 个致病基因,并对其中一个基因调控信息素相关基因的表达进行研究。 研究工作相对完整可靠,向NCBI 正式提交了本项目数据提交申请,并获得正式注册（项目注册号234332：http：//www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/234332）。 课题研究期间发表研究论文2篇,培养研究生3名,通过项目实施,项目主要成员获得国家自然科学基金地区联合资助项目1项。