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本发明公开了一种转基因玉米的多重PCR筛查检测引物及检测方法,所述引物具有较强的特异性,能够用于多重PCR筛查检测分析。所述检测方法提供了一种操作简便、扩展性能好、灵敏度高的转基因玉米筛查检测方法,实现了转基因玉米的多靶标检测。利用毛细管电泳对PCR扩增产物进行分析,其片段大小区分率可达数个碱基,分辨率高。本发明的引物和检测方法为转基因玉米多靶标检测提供了一种简单、方便、有效、可靠的高通量检测方法。本实验建立的多重PCR反应体系不仅可以检测进口转基因玉米外源基因成分,而且还能扩增到其他转基因作物筛查检测。