[00139301]水稻苗期耐盐基因qSTS8的精细定位与候选基因分析

土壤盐渍化是危害水稻生产的重要非生物胁迫之一。宁夏土壤盐渍化非常严重,水稻生产受其影响极为明显。本研究利用法国稻和日本晴的耐盐F3家系与日本晴连续回交2代获得的BC2F2次级定位群体将qSTS8定位区间缩小到1个366Kb的区间内;利用BC3F2群体进行交换单株筛选和表型评价,采用染色体片段代换定位策略,最终将水稻苗期耐盐基因qSTS8精细定位到水稻8号染色体长臂端Indel标记MK8和SSR标记OSSR8之间1个30Kb区间内,包含3个预测基因。结合盐胁迫和正常生长条件下日本晴和耐盐近等基因系NIL（FSTS8）的转录组测序结果,将精细定位区间与基因组表达谱和SNP信息整合,通过对区间内3个预测基因两亲本的测序分析,结合基于候选基因的关联分析,发现预测基因1的编码区在两亲本间有1个12bp的Indel,编码蛋白质结构发生了很大变化;预测基因2两亲本之间存在3个SNP和2个单碱基Indel,盐胁迫后,两亲本该基因表达量有明显差异;预测基因3在两亲本间无差异;最终确定预测基因1和2为耐盐候选基因,发现了2个功能性突变位点,发掘了1个具有潜在利用价值的有利等位基因,可用于水稻耐盐分子育种。本项目研究结果不仅为水稻耐盐分子机理研究提供重要参考,而且为利用分子育种途径提高水稻品种耐盐性提供理论支持。在项目的支持下,发表学术论文4篇,其中一级学报1篇,核心期刊2篇,培养毕业2名硕士研究生。