[00140503]细菌基因组测序及分析

细菌基因组的深入研究可以揭示微生物的遗传机制,发现重要的功能基因,这对疾病鉴定、药物研发和食品研究都将产生巨大影响。目前美吉主要采用第二代高通量测序技术进行细菌样本的测序,并且公司已经引进了第三代测序技术。 创新点：项目采用Roche 454 长片段双末端测序技术（Paired-End）搭建基因组框架,然后进行Illumina短片段高覆盖测序（100×）,将短片段序列mapping到基因组框架中,获得高质量的细菌基因组精细图。在此基础上,借助ABI3730xl测序平台对整个基因组或其中的某一区域进行Gap Closing,得到细菌基因组完成图。 先进性：公司在细菌基因组生物信息分析方面已经实现了分析流程一键化操作,项目的分析周期比原来缩短五倍;并且,美吉拥有大量细菌基因组项目经验,对于各类微生物样品有详尽制备方法;此外,美吉拥有专业的微生物基因组分析团队,5年以上项目经验的专家多名。 该项目已获得“美吉生物信息提取gbk-extract.pl软件V1.0”的软件著作权。该软件用于提取生成基因组核苷酸序列、基因氨基酸序列、gff基因位点等文件,以用于后续的比较基因组、基因组进化树等分析,支持细菌基因组完成图、精细图等多种基因组水平的NCBI genebank 格式文件的提取和分析工作。 上海美吉生物医药科技有限公司是集研发、生产和销售于一体的有限责任公司,是上海市认定的高新技术企业和高技术服务企业。公司拥有先进的进口仪器设备12套,并且还在持续跟进最先进的测序平台。美吉对本项目投入了大量资金,软硬件同步跟进,保证了本项目的顺利转化与运行。截止目前,美吉已成功为百余所高校、科研机构、医院等提供了细菌基因组测序及分析服务。