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在广泛收集菊属及其近缘材料的基础上,利用表型性状分析(常规生物学性状和孢粉学)和分子序列解析(ITS、rpl16和trnL/trnF IGS)的方法研究系统发育问题。根据孢粉学信息,基于花粉外壁纹饰及花粉表面刺的形态和大小,菊属及其机缘类群可被分为3大类。根据24个形态性状和1个生物学性状的聚类结果与传统分类结果基本吻合,表明本研究所涉及的性状指标可以作为菊属系统发生关系研究的有效辅助指标。根据分子系统树蒿亚族分支主要包括两个亚分支即菊属群(包括菊属、亚菊属和紊蒿属)和蒿属群(包括蒿属、栉节蒿属和芙蓉菊属);而百花蒿属、喀什菊属、线叶菊属、Phaeostigma、短舌菊属等可能是蒿亚族的原始类群。综合多方面结果,蒿亚族主要包括三个类群即蒿属群、菊属群和原始类群,且菊属群和蒿属群分别由原始类群独立演化形成;菊属群包括菊属、亚菊属、短舌菊属、Arctanthemum和太行菊属(根据我们的结果应归于蒿亚族),短舌菊属可能是该属群的基部类群;蒿属群包括蒿属、芙蓉菊属和栉节蒿属等,栉节蒿属可能是该属群的基部类群。菊属与亚菊属亲缘关系很近,属间分化和属内种间分化较晚,菊属可能从亚菊属的不同种或种群演化而来,太行菊属则可能是亚菊属的较近原始类群。