[00145439]水稻直链淀粉含量QTL整合及SSR标记开发作图研究

我国是世界上最大的水稻生产和消费国,水稻也是我国第一大粮食作物。直链淀粉含量是影响稻米食味品质的最主要因素之一。最近几十年来,水稻直链淀粉含量遗传与测定方法等研究取得了较大的进展,并且伴随分子生物学的迅猛发展,水稻直链淀粉含量分子机理与基因定位方面也有了不少的报道,随着水稻基因组测序计划的完成,水稻高密度分子遗传连锁图谱和各种近等基因系群体的构建,与水稻直链淀粉相关数量性状位点（QTL）不断被定位。QTL定位和分析可为分子标记辅助选择改良稻米品质和开展相关基因的精细定位及图位克隆提供理论基础。 但由于现有的QTL定位结果绝大多数是使用区间作图方法,选用的作图群体小等原因使得QTL被标定的标记区间跨度较大,从而在不同研究中定位的QTL（即使是同一位点）存在位置差异,所以至今能够在育种中应用的有效标记较少。图谱整合是弥补单个作图群体因分子标记多态性的局限性而难以构建高密度图谱的有效方法。 本研究采用近红外谷物分析仪测定法、改良的标准测定方法以及单粒法3种测定方法,对精米粒、糙米粉、精米粉、糙米粒进行其直链淀粉含量的测定,探索适用于遗传分析的直链淀粉含量测定方法;收集国内外研究发表的与水稻直链淀粉含量相关的QTL信息,利用QTL整合软件将其整合成一致性QTL,确定直链淀粉含量相关QTL密集区,并对该区段内DNA序列进行分析,寻找该区间的简单重复序列,根据其两端的保守序列,利用SSR设计软件设计新的SSR引物,开发出与之连锁的SSR分子标记,并在彩×龙粳26 F2群体上验证其多态性,试图将与水稻直链淀粉含量相关QTL区间缩小,为水稻直链淀粉含量分子辅助育种提供可被选择的可靠分子标记,提高育种者选育优质水稻品种的效率。 本研究的创新之处： 1、首次将水稻直链淀粉含量相关QTL整合出高密度的遗传图谱。 2、在水稻直链淀粉含量研究中首次利用DNA序列分析简单重复序列,开发SSR标记引物 本研究开发和筛选出的与水稻直链淀粉含量相关的SSR标记,为水稻直链淀粉含量遗传研究和品质育种提供了有力分子工具和理论基础,目前该项技术已被多家水稻育种单位应用。通过对水稻直链淀粉含量相关SSR标记检测,结合常规的育种手段,加快了水稻新品种的选择速度,缩短了育种进程,培育出的优质水稻品种（系）,为水稻育种提供优良育种实验材料和种植品种,优质品种的种植,减少了农药、化肥的施用,降低了种植费用,增加了农民收入,产生了良好的生态效应和社会效应。