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构建了两个猪基因组文库,分离到5个新的微卫星标记,其DNA顺序均被Genbank收录,其中3个被用于长白等效猪种遗传多样性评估,效果良好;完成了国际上尚未定位的个位点染色体定位;用单精子分型和自建的参考家系分别完成了如指掌个位点的遗传作图,提高现有图谱中部分区域的精度;用计算机模拟比较了微卫星标记辅助选择法与传统选择法的效果,用参考家系信息包括微卫星基因型检测确定了解情况与猪经济怀状有关的微卫星;采用FAO推荐的一套微卫星标记评估我国地方猪遗传多样性。其中二价染色体上微卫星定位,单精子分型构建猪遗传图谱,用FAO推荐的微卫星标记评估中国地方猪遗传多样性等均为国内外首次开展。该研究表明微卫星标记在猪的亲缘鉴定、血缘控制、品种分类、品种鉴别、遗传多样性评估、数量性状定位、早期选择、标记辅助育种等方面均具有重要的应用价值。