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1、课题来源与背景; 来源:本科技成果为本公司自主研发。 背景:微生物多样性是微生物和它们组成的系统的总体多样性和变异性,其研究对资源的保护、合理开发和利用提供了科学依据。基于高通量测序的微生物多样性检测,是用物种特异的rRNA序列对应的测序序列条数来反映该微生物存在于环境中的丰度。由于环境样品需要经过核酸提取,rRNA高变区扩增,样品制备,上机测序和生物信息分析等实验环节,流程较长。其中,rRNA高变区扩增步骤会引入一定程度的偏向性,所以需要一个标准样品对整个流程进行监控,并进行必要的校准。 2、技术原理及性能指标: 以rRNA通用引物对同时对由15种微生物的SSU rRNA基因序列形成的五个丰度梯度的样品进行扩增,将所得产物建库,并进行高通量测序,与样品中的SSU rRNA区域进行基因序列比对,将所得出的各个菌种对应的测序序列条数代表其经过扩增及测序后的相应丰度,所得丰度与样品中各个微生物所含序列的原始丰度成正比。 3、技术的创造性与先进性: 本发明提供的标准对照样或对照试剂盒,包括若干种微生物的SSU rRNA和至少一组rRNA通用引物对。该标准对照样或对照试剂盒中,还包括三组平行试样,保证实验的准确性和稳定性。以相同的引物对同时对含有若干种微生物的RRNA基因序列的样品进行扩增,实现对高通量测序的流程进行监控。 4、技术的成熟度,适用范围和安全性; 本技术已成熟应用,适用于大多数细菌、真菌等微生物,使用安全。 5、应用情况及存在的问题; 本技术已进入产业化应用阶段,基本不存在问题。 6、历年获奖情况; 无