[00020041]一种基于树搜索和片段组装的蛋白质结构预测方法
技术详细介绍
一种基于树搜索和片段组装的蛋白质结构预测方法，包括以下步骤A1、获取蛋白质的pdb格式的文件并清洗出所需数据；A2、生成片段库；A3、选取力场模型；A4、采用Rosetta的score3能量函数；A5、将整个能量图景离散化，并将每层进一步离散化，分成单独的分块区，每次搜索根据能量的权重随机选取一个能量层，并在该能量层依概率选取一个分块区，如果分块区中包含有构象，采用片段组装方法，随机选取序列上的一个片段，然后在片段库中随机选取一个片段，替换序列上的目标片段，用蒙特卡洛准则来判断是否接受这个构象，如果接受则将它放入一个集合当中。本发明可以大大减少计算量和计算时间，保证搜索到能量较低的构象。
