[00003330]基于分子动力学模拟的核受体介导内分泌干扰物质的虚拟筛选方法
技术详细介绍
本发明公开了一种基于分子动力学模拟的核受体介导内分泌干扰物质的虚拟筛选方法，属于环境可疑内分泌干扰物的虚拟筛选与活性预测领域。本发明是将受试小分子经过优化后和实验或者同源模建获得的受体文件进行对接组成复合物，然后用GROMACS软件包进行分子动力学模拟。对受体的12号螺旋进行运动轨迹分析，空间位置的均方根偏差分析随时间的变化曲线来鉴别具有受体活性的污染物质，在规定时间内，曲线趋于稳定的可以认为对应的螺旋定位到确定的位置，于是具有生物活性。然后再通过考察定位的位置来判断拟性还是抗性。
