本发明公开了一种面向大区域海量DEM数据流域提取的并行方法,其步骤如下:第一步、最优划分粒度评价;第二步、按照数据划分、融合策略进行洼地填平并行计算;第三步、按照数据划分、融合策略,基于洼地填平结果进行水流方向并行计算;第四步、按照数据划分、融合策略,基于水流方向数据,进行汇流累积并行计算;第五步、按照数据划分、融合策略,基于水流方向和汇流累积数据,设置汇流阈值,进行河网水系并行计算;第六步、按照数据划分、融合策略,基于河网水系和水流方向数据进行子流域划分并行计算,完成流域提取。本发明方法能够在并行时充分考虑数据划分的粒度及进行I/O机制,在串行算法解析上能够顾及数据自身特征。