本申请公开了一种船舶控制器软件配置方法,包括:获取用户利用中文关键词库在办公软件中输入的设置信息;利用预设的算法解析设置信息,生成脚本文件;将脚本文件发送至下位机,以使下位机利用脚本文件运行。可见,本申请用户可以利用中文关键词库在办公软件中用中文直接输入设置信息,使得用户可以利用中文关键词库中的关键词,直接输入中文完成对程序的配置,而无需用户输入程序代码,对于用户专业要求性大大降低,再利用预设的算法解析设置信息,将用户输入的中文设置信息,转换为计算机语言,生成下位机可以直接使用的脚文本件,并发送至下位机,以使下位机利用脚本文件运行。另外,本申请还相应公开了一种船舶控制器软件配置系统。