本发明公开一种基于MUSIC算法的频率分集阵列两层介质目标定位方法,通过确定电磁波在两层介质中的传播路径,推导出两层介质的频率分集阵列的发射‑接收波束方向图;通过两组不同频偏使接收到的回波包含解耦后的距离、角度信息,根据L个回波信号快拍数据得到回波信号协方差矩阵的估计值;对上述得到的估计值进行特征值分解,根据特征值大小,把与目标源个数K相等的特征值和其对应的特征矢量看成信号子空间,将余下的2N‑K个特征值和特征矢量看成噪声子空间;根据上述得到的噪声子空间构造谱函数,使距离和角度变化进行逐点计算,从而寻找波峰估计出目标位置。本发明利用MUSIC算法实现了FDA雷达各阵元单发单收机制下对多层介质中遮挡目标的定位。