联系人: 哈尔滨工业大学
所在地: 黑龙江哈尔滨市
摘要:基于R‑SVM和TPR规则的基因功能预测方法,涉及一种基因功能的预测方法。本发明可以实现对基因功能的预测,能够解决采用分类算法实现基因功能预测时所存在的多标签问题以及层级约束问题。本发明首先将已知功能的基因作为训练样本,构成训练集;针对GO注释方案中的每个节点,构造正样本集和负样本集;针对GO注释方案中的每个节点,选择对该节点的功能进行分类时贡献较大的属性;通过训练得到一组R‑SVM分类器并对未知样本进行分类预测,得到一组初步R‑SVM分类结果;将分类结果转化为后验概率值,使用针对有向无环图层级结构的带权重的TPR集成算法,实现基因功能的预测。本发明适用于基因功能的预测。