摘要:本发明公开了一种基于质谱谱图的无标蛋白质定量方法,包括如下步骤通过理论酶切的理论蛋白质序列数据库获得相应的理论肽段集;提取一级质谱谱图(MS)上所有离子的提取离子流色谱图(XIC),并计算提取离子流色谱图上相应的保留时间(RT)和质荷比(M/Z);建立理论肽段集和提取离子流色谱图的同位素分布和保留时间的多重映射关系表。本发明提出采用结合智能优化算法的无标蛋白质定量算法,通过智能优化算法在上述多重映射关系表中取得理论肽段集和提取离子流色谱图的最佳映射关系并获得定量结果。通过进行肽段的高效定性,本发明能得到较高的蛋白质检测覆盖率,从而给蛋白质进行高通量定量。研究表明细胞中蛋白质表达丰度的变化对于疾病的早期诊断具有重要意义。