本发明公开一种船舶分段建造车间作业调度系统及其调度方法,包括用于编辑各类信息的基础信息管理模块、用于生成作业调度计划的作业计划与调度模块以及用于操作管理已生成计划的分段计划管理模块,其调度方法包括:通过基础信息管理模块完成待调度分段信息的录入;通过作业计划与调度模块完成分段作业调度计划的生成与查看,通过分段计划管理模块完成分段计划的管理与执行。本发明提出的分段建造车间作业调度方法,以系统化的管理思想,实现计算机辅助作业调度过程,为船厂调度人员在作业调度计划编制过程中提供便捷、合理、智能的流程指导和管理规划。