本发明公开一种船体分段装配序列规划系统及其规划方法,包括装配资源管理模块、装配序列规划模块、装配序列仿真模块以及装配序列评价模块;首先,装配资源管理模块完成分段相关信息的录入和装配相关规则的编制;其次,装配序列规划模块通过导入分段信息、确定装配初始条件进行装配序列推理;随后,装配序列仿真模块根据装配序列规划模块的推理结果规划装配路径进行装配过程的仿真;最后,装配序列评价模块对待评价装配序列进行模糊综合评价。本发明能够为装配工艺人员在船体分段装配工艺设计和仿真验证及评价优选的整个工艺过程中提供高效、准确、智能化的解决方案,对提高工艺编制效率、缩短分段建造周期有着重要的意义。