本发明公开了一种船模试验水池液位自动控制系统,由嵌入式处理器模块、液晶触控屏、电源、经认证的手机、GSM通信网络、GSM模块、第一液位传感器模块、第二液位传感器模块、第一发射器模块、第二发射器模块、接收器模块、无线网络、第一继电器、第二继电器、进水电磁阀模块和放水电磁阀模块组成;本发明提供的船模试验水池液位控制系统及其控制方法,管理员无需关心初始的液位高度,只要设置好需要的液位高度,系统能够自动判断进行注水或放水操作,能够实现无人值守的注水、放水过程,并能实时对液位高度进行检测控制,同时具有远程操作功能,控制精度高,安全可靠。本发明还公开了一种船模试验水池液位自动控制方法。