本发明公开一种基于数理统计的船用柴油机机加工零件编码方法及系统,零件编码管理系统包括电源模块以及分别与电源模块相连的中央处理器、零件基本信息管理模块、零件设计制造资源模块、零件编码体系数理分析模块、零件编码模块和编码信息综合处理模块;零件编码体系数理分析模块通过中央处理器调用零件基本信息管理模块、零件设计制造资源模块,结合频谱直方图确定各码位编码范围,通过多次编码试套确定各特征码位值,零件编码模块读取待编码零件形状信息、工艺信息和零件编码体系信息,并生成零件编码;本发明用数理分析的方法综合统计分析船用柴油机机加工零件各码位,保证了编码体系的实用性和针对性。