本发明公开了一种主动声呐识别方法,该方法是发射方在声呐发出的探测信号中嵌入水印,接收方通过对水印的探测来识别发送方信号,包括四个部分,数字水印预处理,水印生成,水印嵌入,水印探测。具体方法是在一个声呐波形的时频系数中嵌入水印,水印是由两个安全密钥产生。第一密钥是扩展码。第二密钥是用于选择和修改声呐的所选择的时间‑频率单元的嵌入掩模,根据嵌入规则水印分布在声呐探测信号的分块DCT系数中,匹配滤波接收器产生经过信道模型的扩频水印的复制相关水印,探测器模型成功的检测需要访问这两个扩展码和嵌入掩模。本发明可以产生精度更高的检测概率,增加了可控性和识别性能。