本发明提供一种基于LED标签跟踪的三维几何测量方法及系统,通过将三维扫描仪设置成可沿轨道移动并距离待测物体较近,来灵活、方便地采用结构光方法对大尺度物体进分块行局部测量,获得高清局部图像;同时,由于LED标签的灯光足够亮,立体跟踪仪在与LED标签的距离增大时,也能够快速、准确地跟踪LED标签,以保证服务器能够精确定位LED标签的中心位置及其在三维扫描仪坐标系中的位置,精确获得两个局部测量之间的LED标签关系,进而准确评估三维扫描仪的姿态变化,实现对局部测量结果的精确拼接,而且无需进行多个投影仪之间的繁琐切换,就能够方便、稳定、精确地完成对大尺度物体整个轮廓的三维测量。