本发明公开了一种侧基含磷阻燃多元醇及其制备方法,具体包括以下步骤:1)将溶剂和新戊二醇置于反应釜,滴加三氯氧磷,制得中间体新戊二醇磷酰氯;2)将溶剂和小分子三元醇或四元醇置于反应釜中,加入缚酸剂,滴加溶剂溶解的中间体,回流反应,冷却,过滤,洗涤,得到侧基含磷阻燃多元醇。本发明提供的侧基含磷阻燃多元醇原料价廉易得,不含卤素,环保无毒,工艺简单可控,含有的2个或3个活性端羟基可与异氰酸酯反应制备侧链含磷本质阻燃聚氨酯材料,既克服了外添加型阻燃剂在水基聚氨酯体系中配伍性差、易迁移析出等缺陷,又解决了传统主链含磷多元醇由于磷酸酯键不耐水解而造成聚氨酯主链结构断裂进而导致材料理化性能下降的问题。