本发明提供了一种用于城市雨水排放的具有脱氮除磷功能的生物滞留池结构及其制备方法,本发明的方法包括铺设一层卵石底层作为承托层并在其上铺设一层砾石结构,然后铺设由粗石英砂或砾石和铁屑组成的混合填料层,混合填料层高度为20~40cm,再铺设高度为30~70cm的由农林废弃物制作的生物质颗粒和土壤组成的生态结构层。由上述方法得到的生物滞留池结构可以在保证路面水快速排出的同时,实现对氮磷的高效截留去除,从而保证了良好的城市水体环境和生态功能。本发明实现了对农林废弃物的有效利用;本发明的生物滞留池适用于城市多种绿化带和景观区的建设。