本发明公开了一种船舶余热淡化系统及淡化方法,包含热回收蒸汽发生器、蒸汽压缩机、有机工质朗肯(ORC)循环、热水箱、冷水箱、热水热回收换热器和排水热回收换热器;所述热回收蒸汽发生器由密封板分为上下两部分,下部分为烟气热回收腔,烟气入口设有第一阀门,烟气出口设有烟气净化器和排放用第二阀门,冷却介质通入热回收换热管中换热;顶部排汽口一路通过第六阀门与真空泵相连,另一路通过第七阀门与蒸汽压缩机入口连通;所述蒸汽压缩机出口与ORC循环相连,ORC循环分别与热水箱及热水热回收换热器连接。本发明结构设计合理、制造简单、高品质、高效率、连续供应的船用余热蒸汽压缩自循环式海水淡化系统及冷热水制备装置。