本发明公开了一种脂肪酶催化制备环氧大豆油的方法,包括以下步骤:将大豆油、有机酸、表面活性剂和脂肪酶按照150~250份:1~3份:1~3份:3~8份的重量份数比混合均匀,搅拌升温至20~22℃,然后加入尿素过氧化氢10~14重量份,反应5~8h后,取样,离心、碱洗然后水洗,最后氯化钙干燥得到环氧大豆油产品。本发明以尿素过氧化氢作为氧源,使用脂肪酶催化反应制备环氧大豆油,使反应获得更高的环氧值并能使酶保持较高的活性,不易失活,反应条件温和,能耗低,催化反应特异性强,不易产生副产物,产品纯度高,对环境友好。