本发明一种自动调节流量的电主轴实时冷却系统及控制方法,包括控制单元,与电主轴的冷却结构相互连接形成冷却回路的液冷却机,设置在电主轴上的温度传感器,以及设置在液冷却机的出液口的管道上的电动流量调节阀。本发明通过设置的电动流量调节阀和温度传感器与控制单元以形成闭环控制回路,来实现冷却液流量的实时动态调整,从而有效控制不同加工工况下的电主轴温升,减小热变形,提高加工精度。由于采用闭环温度控制的方法,突破了传统开环循环冷却的方式,能够根据不同的加工工况对冷却液流量进行准确地动态调整,从而有效控制温升;且结构简单易实现,能够充分利用冷却系统,使电主轴温度分布均衡,减小电主轴热变形,提高机床加工精度。