本发明公开了一种填孔聚氨酯防水透湿膜,包括基膜和填孔材料,填孔材料的质量为基膜和填孔材料总质量的5%~85%,且填孔材料为亲水性单体和疏水性单体在交联剂的作用下经原位交联聚合形成的共聚亲水性高分子,所述的填孔材料中亲水性单体、疏水性单体和交联剂的质量百分含量分别为:亲水性单体:20%~90%;交联剂:1%~9%;疏水性单体:余量。本发明同时公开了其制备方法。本发明所述填孔材料对水分的吸收和透过能力大大增强;所述填孔材料与基膜之间的结合力明显提高;所述复合膜结构具有良好综合力学性。且防水透湿膜的制备过程,尤其是将填孔材料引入基膜的微孔中的过程快速、简单、有效。