本发明公开了一种用于船舶分段建造的柔性胎架系统,包括若干个建造支撑单元、驱动机构和与驱动机构连接的PLC控制系统和上位机,所述建造支撑单元包括两个用于支撑船舶分段的支撑固定机构和与每个支撑固定机构连接的柔性胎架机构,柔性胎架机构与驱动机构连接,柔性胎架机构为可升降机构,所述上位机将控制量传递给PLC控制系统,PLC控制系统控制驱动机构驱动柔性胎架机构运动到合理的位置,调整船舶分段的位置。本发明的一种用于船舶分段建造的柔性胎架系统,将加工区域分布有若干个支撑点,根据需要选择合适的支撑点,采用初调和微调相结合的调节方式,实现船舶分段的精确定位。