本发明公开了一种可更新心脏起搏器内部固化软件的程控系统,包括体外程控仪射频收发装置、与体外程控仪双向数据无线传输的起搏器遥测电路,起搏器遥测电路与一个微处理器双向连接;所述微处理器内含有一个用于程序运行时变量和数据缓存的随机访问存储器和一个可改写程序的只读存储器;该只读存储器分为三个存储区:用于存储起搏器默认模式、运行参数和版本信息的程控参数存储区、用于存储起搏器当前版本控制软件的主程序区和用于改写起搏器主程序的自举程序区。本发明还包括一个通过程控仪射频场收发装置作用于起搏器遥测电路对起搏器软件更新的程序和一个存储于起搏器闪烁存储器中自举程序区的自举程序。