一种针对反应堆中子扩散方程的非均匀几何变分节块方法,包括如下步骤1、建立包含节块内部的中子守恒关系以及节块表面的流连续性条件的泛函;2、利用x‑y方向的有限元形状函数和分片常量多项式对节块进行离散,实现非均匀节块的几何和材料的描述功能;3、推导得到响应矩阵方程;4、利用红‑黑扫描的方式对响应矩阵方程进行求解,最终得到整个非均匀求解区域的中子通量密度分布;本发明能够精细描述核反应堆的非均匀栅元结构;该方法将基于变分节块法,采用等参有限元来处理节块内部的精细几何结构,实现非均匀几何的中子扩散方程求解。