本实用新型公开了一种自动指纹识别系统,其包括电源管理模块,指纹匹配处理模块,以及与指纹匹配处理模块连接的指纹采集模块、人机交互模块、系统接口模块、存储模块;其特征在于指纹匹配处理模块包括:可对指纹采集模块收集的指纹图像进行指纹特征信息的提取,并可进行精确匹配的核心处理器DSP;可对核心处理器DSP传送的特征进行信息粗匹配处理的协处理器FPGA。本实用新型的有益效果是:实现了嵌入式自动指纹识别,提高了指纹识别效率和指纹存储效率,并采用了模块化设计便于根据不同场合需要的改动,大大提高了本系统的实用性。