本发明公开了基于胡椒和荜拔的治疗脑缺血活性部位药物及制备方法,所述基于胡椒和荜拔的治疗脑缺血活性部位药物的制备方法包括:按照质量比1∶1取胡椒和荜拔药材,粉碎后采用二氧化碳超临界设备萃取;将萃取后剩余的药渣加入多功能提取罐,加10倍量70%的乙醇回流提取3次;将提取液过滤后浓缩,加3倍量的二氯甲烷萃取3次,用旋转蒸发仪浓缩成流浸膏后放入鼓风干燥箱中烘干既得活性部位。本发明降低了胡椒和荜拔组合物自身的刺激性,对永久性脑缺血大鼠的神经功能症状都有不同程度的改善,结果充分证实所制备的有效部位毒性较低且具有良好的神经保护作用。