本发明公开一种操作简单、高效且可分别得到分子量大于100kDa、20-50?kDa以及2-10kDa的牡蛎多糖组分的牡蛎多糖的制备方法,依次按照如下步骤进行:将水加入到牡蛎肉中,匀浆;水与牡蛎肉的比例为1~5L:100~500g;将匀浆在50~100℃条件下加热10~60min,在1000~10000rpm条件下离心10~30min,取上清液;将上清液加入到疏水树脂柱中进行层析,分别以水、5%乙醇及15%乙醇洗脱,每次洗脱至洗脱液中不含糖;分别得到水洗脱组分、5%乙醇洗脱组分及15%乙醇洗脱组分;分别向水洗脱组分、5%乙醇洗脱组分及15%乙醇洗脱组分中加入80%乙醇至饱和浓度,得三种沉淀。