本发明公开了一种角鲨烯和维生素E的分离方法。该方法采用β‑环糊精包结分离含角鲨烯和天然维生素E混合物,利用β‑环糊精和角鲨烯、天然维生素E不同底物弱相互作用力的差异,在温和的条件下通过对角鲨烯的优先吸附达到纯化分离的目的。少量乙醇溶解的角鲨烯和天然维生素E混合物,在恒温条件下滴加到饱和β‑环糊精水溶液中,恒温搅拌,冷却静置析出包结物,过滤,真空干燥,包结物中的角鲨烯和天然维生素E用无水乙醇萃取出。本发明具有分离条件温和、工艺简单、节能环保、分离载体可重复利用、还避免了物质因具有热敏性所容易发生氧化现象等特点。